フィリピンヒゲイノシシには、ルソン地域の亜種とミンダナオ地域の亜種が知られています。頭の毛並みは亜種によって異なりますが、野生での行動や食物には未解明の点が多いです。
専門家グループの記載では、ルソン地域の亜種は灰色がかった頭頂の房毛と前向きの房を持ちます。ミンダナオ地域の亜種は黒っぽいたてがみと、白っぽい頭頂の房毛を持ち、前向きの房は目立たないか見られません。
2014年8月9日午後6時35分、ボホール島のラジャ・シカトゥナ保護景観区内のぬた場で、1頭が自動カメラに写りました。
ルソン島のバナハウ・デ・タヤバス山では、17日間の調査で3回、計5頭が撮影されました。単独の成獣2頭の記録に加え、成獣のメス1頭が幼獣2頭と一緒に写っていました。
絶滅のおそれの評価は、まだ掲載していません。