エクアドルヒメサシオコウモリは、背中と腹で毛の色の重なりが異なる小型のコウモリです。空中で小さな虫を捕らえ、洞窟や使われなくなった鉄道トンネルをねぐらにします。
背の毛は黒褐色の毛先、茶色の毛軸、淡い灰褐色の根元が重なる三色で、腹側はより淡い色合いです。
飛びながら小さな昆虫を捕らえ、洞窟の薄暗い場所や使われなくなった鉄道トンネルで休みます。
翼の膜は黒色で、顔の下側には毛がありません。
耳は楕円形で、頭頂から少し突き出します。耳の内側には目立つひだがあります。
頭胴長は37〜42mm、尾の長さは12〜18mmで、体重は4〜5gです。
絶滅のおそれの評価は、まだ掲載していません。