マドゥラカグラコウモリは、ジャワ島東部とマドゥラ島に分布するカグラコウモリです。低地林や石灰岩の洞窟を利用する記録があります。
外見は近縁のHipposideros larvatusに似ていますが、分類研究で比べた標本では頭骨が小さく、寸法や形が識別に使われます。
昆虫を食べ、石灰岩の洞窟をねぐらにし、単独または小さな群れで暮らすとされています。森林ではねぐらの近くで採餌します。
絶滅のおそれの評価は、まだ掲載していません。