昼に崖や峡谷の岩場を使い、樹皮で無脊椎動物を探します。西イワゴジュウカラとの分布重複域では、目の後ろで太くなる黒い過眼線が見分ける手がかりです。
西イワゴジュウカラと分布が重なる地域では、ヒガシイワゴジュウカラの黒い過眼線は目の後ろで幅広くなります。頭とくちばしも、相手より大きく重いとされます。
昼行性で、崖や峡谷、岩場のほか、松林や砂漠の縁にも見られます。木の幹や樹皮で無脊椎動物を探して食べます。
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