フランシスキクガシラコウモリは、ボルネオ島のサバ州とカリマンタンで記録された比較的珍しい種です。2015年の論文時点で知られていた記録は6件でした。
鼻葉は暗褐色で、横に小さな張り出しがあります。体毛は根元が淡いクリーム色で、毛先は灰褐色です。
ボルネオ島の記録は、手つかずの常緑林と伐採された常緑林の両方から得られています。研究時点で標本・記録数は少なく、生態の全体像は限定的です。
絶滅のおそれの評価は、まだ掲載していません。