スミスクロハツカネズミは、メキシコ州の調査標本で腹側の毛色に個体差があり、松林やカシ林などで多く記録されました。
メキシコ州の標本では、腹側の毛色が淡い個体から暗い個体まで幅広く記録されました。
同じ調査では妊娠したメスや授乳中のメスと幼獣が記録され、テンアンゴ・デ・アリスタでは倒木の下に巣が1つ見つかりました。
絶滅のおそれの評価は、まだ掲載していません。