サンフアンツコツコは、灰色がかった毛をもつツコツコです。カニャーダオンダの標本では、尾の先に黒っぽい毛の房があります。サンフアン州の乾いた砂礫地では、木の下の裸地に穴の記録があります。
背の毛は灰色がかり、わき腹はより淡い色です。カニャーダオンダでは腹側が白っぽく、ペデルナルではクリーム色のものが得られています。
サンフアン州の採集記録には、木の下のむき出しの土に穴が掘られていたとあります。
鼻の上には、はっきりした黒っぽい斑があります。
カニャーダオンダで得られたものでは、耳の付け根から頬へ淡い毛の帯が伸びています。
カニャーダオンダの標本では、尾の先は上側が黒っぽく、下側は淡い色です。尾の上面には、毛の稜が目立ちます。
四肢の上側は、白っぽい毛に覆われています。
絶滅のおそれの評価は、まだ掲載していません。