フィリピンアナツバメは、深く切れ込む尾と濃い茶色の背が目印です。ミンダナオ島の亜種は全体にさらに濃い色をしています。
尾の切れ込みは深く、上面は黒みのある茶色、下面はそれより淡い茶色です。ミンダナオ島の亜種A. w. origenisは全体にさらに暗い色をしています。
ミンダナオ島のアポ山周辺では、7月に木の空洞から本種のものと考えられる巣が採集されました。丸い巣は植物材料で作られ、だ液を含んでいませんでした。
頭はがっしりとしており、腰は背中と同じように暗色です。足の下部には羽毛がありません。
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